Sekolah Menengah Atas Negeri 1 Batam (SMAN 1 Batam) berdiri pada tahun 1987, dengan nama Sekolah Menengah Atas Negeri (SMAN) Batam Barat, dan Kepala Sekolah pertama adalah Bapak Drs. Zakir.
Pada saat itu, SMAN 1 Batam belum memiliki gedung sendiri dan masih menumpang di SMPN 3 Batam, di Sungai Harapan – Sekupang – Batam.
SMAN 1 Batam baru menempati gedung sendiri di jalan R. Seprapto – Sekupang – Batam, sejak tahun 1990. Dengan Kepala Sekolah pada saat itu adalah Bapak Drs. Azadin Amal.
Nama SMAN Batam Barat berubah menjadi SMAN 1 Batam pada tahun 1994 dimasa Kepala Sekolah Bapak Drs. Zailani Arifsyah.
Kepala Sekolah SMAN 1 Batam sejak dari mulai berdiri sampai sekarang adalah :
- Drs. Zakir (1987 sampai dengan 1988)
- Drs. Azadin Amal (1988 sampai dengan 1993)
- Drs. Zailani Arifsyah (1993 sampai dengan 1998)
- Dra. Ponco Rini (1998 sampai dengan 2002)
- Dra. Dewi (2002 sampai dengan 2004)
- Dra. Ira (2004 sampai dengan 2005)
- Dra. Lely Suriati (2005 sampai dengan 2012)
- Muhammad Chaidir, S.Pd., M.Pd (2012 sampai dengan 2016)
- Dra. Dwi Sulistiyani (2016 sampai dengan sekarang)
Pada saat ini, SMAN 1 Batam merupakan sekolah unggulan di Kota Batam.